Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms