Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms