Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms