Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd4aQ8CBY1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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