Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slfn5Q8CBA2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms