Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Usp20Q8C6M1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Usp20Q8C6M1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Usp20Q8C6M1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Usp20Q8C6M1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Usp20Q8C6M1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp20Q8C6M1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Usp20Q8C6M1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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