Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6K9

Col6a6, Collagen alpha-6(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a6Q8C6K9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Col6a6Q8C6K9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Col6a6Q8C6K9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Col6a6Q8C6K9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col6a6Q8C6K9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col6a6Q8C6K9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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