Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ccdc90bQ8C3X2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ccdc90bQ8C3X2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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