Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg16l1Q8C0J2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms