Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdsp2Q8BX07 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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