Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Zfp398Q8BV16 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp398Q8BV16 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Zfp398Q8BV16 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp398Q8BV16 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Zfp398Q8BV16 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp398Q8BV16 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp398Q8BV16 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp398Q8BV16 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp398Q8BV16 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp398Q8BV16 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Zfp398Q8BV16 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp398Q8BV16 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Zfp398Q8BV16 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Zfp398Q8BV16 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms