Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV13

Cops7b, COP9 signalosome complex subunit 7b, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7bQ8BV13 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms