Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTV1

Tusc3, Tumor suppressor candidate 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tusc3Q8BTV1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Tusc3Q8BTV1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Tusc3Q8BTV1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Tusc3Q8BTV1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Tusc3Q8BTV1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Tusc3Q8BTV1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Tusc3Q8BTV1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Tusc3Q8BTV1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Tusc3Q8BTV1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Tusc3Q8BTV1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Tusc3Q8BTV1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Tusc3Q8BTV1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Tusc3Q8BTV1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Tusc3Q8BTV1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Tusc3Q8BTV1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Tusc3Q8BTV1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tusc3Q8BTV1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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