Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR65

Suds3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3Q8BR65 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Suds3Q8BR65 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms