Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIF2

Rbfox3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbfox3Q8BIF2 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbfox3Q8BIF2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbfox3Q8BIF2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms