Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Htatsf1Q8BGC0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Htatsf1Q8BGC0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Htatsf1Q8BGC0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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