Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dsg1bQ7TSF1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms