Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms