Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms