Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd4Q6ZPR5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms