Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc44a1Q6X893 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms