Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pcp4l1Q6W8Q3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pcp4l1Q6W8Q3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pcp4l1Q6W8Q3 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pcp4l1Q6W8Q3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pcp4l1Q6W8Q3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pcp4l1Q6W8Q3 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pcp4l1Q6W8Q3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pcp4l1Q6W8Q3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pcp4l1Q6W8Q3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms