Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms