Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Atp8b3Q6UQ17 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
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Atp8b3Q6UQ17 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Atp8b3Q6UQ17 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Atp8b3Q6UQ17 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Atp8b3Q6UQ17 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Atp8b3Q6UQ17 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Atp8b3Q6UQ17 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Atp8b3Q6UQ17 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Atp8b3Q6UQ17 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Atp8b3Q6UQ17 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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Atp8b3Q6UQ17 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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