Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms