Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc154Q6RUT8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc154Q6RUT8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms