Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudcd1Q6PIP5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms