Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1cQ6PDZ2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms