Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim37Q6PCX9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms