Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC061212Q6P8K3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms