Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg2aQ6P4T0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg2aQ6P4T0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms