Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Podnl1Q6P3Y9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms