Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3B9

Rbfa, Putative ribosome-binding factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbfaQ6P3B9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RbfaQ6P3B9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RbfaQ6P3B9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
RbfaQ6P3B9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms