Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXZ1

Krba1, Protein KRBA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krba1Q6NXZ1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms