Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rprd2Q6NXI6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms