Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Krt77Q6IFZ6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Krt77Q6IFZ6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Krt77Q6IFZ6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Krt77Q6IFZ6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Krt77Q6IFZ6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Krt77Q6IFZ6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Krt77Q6IFZ6 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt77Q6IFZ6 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt77Q6IFZ6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt77Q6IFZ6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt77Q6IFZ6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt77Q6IFZ6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt77Q6IFZ6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt77Q6IFZ6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt77Q6IFZ6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt77Q6IFZ6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt77Q6IFZ6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt77Q6IFZ6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt77Q6IFZ6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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