Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC6

Tro, Tro protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,087 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TroQ6DIC6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TroQ6DIC6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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