Protein–RNA interactions for Protein: Q66JX5

Fgfr1op, FGFR1 oncogene partner, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr1opQ66JX5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fgfr1opQ66JX5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fgfr1opQ66JX5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fgfr1opQ66JX5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fgfr1opQ66JX5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgfr1opQ66JX5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms