Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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Sdc3Q64519 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Sdc3Q64519 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Sdc3Q64519 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Sdc3Q64519 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Sdc3Q64519 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Sdc3Q64519 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Sdc3Q64519 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Sdc3Q64519 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Sdc3Q64519 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc3Q64519 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc3Q64519 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Sdc3Q64519 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc3Q64519 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc3Q64519 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc3Q64519 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc3Q64519 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc3Q64519 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc3Q64519 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc3Q64519 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc3Q64519 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc3Q64519 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc3Q64519 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc3Q64519 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc3Q64519 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc3Q64519 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc3Q64519 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc3Q64519 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc3Q64519 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc3Q64519 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc3Q64519 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc3Q64519 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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