Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irf4Q64287 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms