Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms