Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nptx1Q62443 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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