Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ss18Q62280 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ss18Q62280 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Ss18Q62280 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Ss18Q62280 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Ss18Q62280 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Ss18Q62280 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Ss18Q62280 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Ss18Q62280 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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