Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpaQ62189 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms