Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Ttf1Q62187 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Ttf1Q62187 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Ttf1Q62187 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Ttf1Q62187 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Ttf1Q62187 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Ttf1Q62187 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Ttf1Q62187 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Ttf1Q62187 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ttf1Q62187 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
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