Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sin3bQ62141 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms