Protein–RNA interactions for Protein: Q61985

Nfe2l1, Endoplasmic reticulum membrane sensor NFE2L1, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l1Q61985 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Nfe2l1Q61985 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfe2l1Q61985 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Nfe2l1Q61985 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nfe2l1Q61985 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Nfe2l1Q61985 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Nfe2l1Q61985 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Nfe2l1Q61985 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Nfe2l1Q61985 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Nfe2l1Q61985 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Nfe2l1Q61985 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Nfe2l1Q61985 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nfe2l1Q61985 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Nfe2l1Q61985 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nfe2l1Q61985 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nfe2l1Q61985 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nfe2l1Q61985 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nfe2l1Q61985 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Nfe2l1Q61985 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nfe2l1Q61985 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Nfe2l1Q61985 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nfe2l1Q61985 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms