Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms