Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms