Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EsrrbQ61539 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms